რობოტნიკის დამარცხების შემდეგ, სონიკი აღმოაჩენს, რომ ბოროტი შადოუ გაექცა სამხედროებს და დაიწყო ქალაქის ნგრევა. შედეგად, სონიკი, ტეილზი და ნაკლზი ერთიანდებიან, რომ დაამარცხონ შადოუ, რომელიც ლეგენდარული უძველესი რელიქივიის “ფლიტვეის ზურმუხტის” ადგილმდებარეობას ეძებს, რომლის მფლობელს საშუალებას აძლევს გაათავისუფლოს უმაღლესი ძალა. ახალბედა ემი როუზი პოულობს გმირებს, რომელსაც შეუყვარდება სონიკი და უერთდება ტრიოს, ისინი მეტალ და სილვერ სონიკებს შეხვდებიან, რომლებიც მათ თავს ესხმიან და ასევე გარბიან. ამასობასი ტომი დ მედი ინტერესდებიან, სად წავიდა ტრიო, რომლის დოსაც გაიგებენ, რომ ხელს უშლიან შადოუს, მეტალ და სილვერ სონიკებს მსოფლიოს ხელში ჩაგდებაში და უმეგობრდებიან სხვა ზღარბს, სახელად ემის და ერთად იწყებენ მათ ძებნას. შედეგად, გმირები მიდიან ტაძარში, სანამ შადოუ იპოვის “ფლიტვეის ზურმუხტის” ადგილმდებარეობას, მაგრამ აღმოჩნდება, რომ უკვე გვიანია.
